限制性内切酶,连接酶等这些酶,他们是怎么来的,是DNA么?还是什么?

首先,不是DNA. 这些酶的本质是蛋白质.
这些酶开始时候都是 从细菌细胞中分离纯化而来,后来多通过基因工程得来.即把这些酶的基因（DNA片段）转化进入某种细菌（一般是大肠杆菌）,再通过细菌大量合成,最后再分离纯化得到.